Dans le cadre de l’appel à projet 2011 le LabEx « CORAIL » financera un total de 461 000€ pour la dotation "2011", à savoir :
- 10 projets incitatifs pour un montant global de 281000€ et des financements par projet allant de 25 000 à 30 000€ par post-doctorant;
- 5 post-doctorants de 12 mois pour un montant qui sera de l’ordre de 180 000€.
L’appel d’offre 2011 comprenait deux volets, un volet « projet de recherche incitatif » et un volet « bourse post-doctorale ».
A l’appel d’offre « projet de recherche incitatif »
10 projets ont été retenu dans leur globalité et donc pour un montant de 25 000€ à 30 000€ chacun :
MELACOMPA
Mise en place d’une étude comparative de la relation homme – milieu marin en Mélanésie
Porteur : Laurent Dousset
Montant : 30 000,00€
Ce projet consiste à initier la proposition Labex Corail EHESS/CREDO dans le cadre d’une première phase exploratoire. A partir des sociétés particulières déjà connues par les participants du projet, il s’agira d’établir un état des lieux des pratiques et représentations locales relatives au milieu marin et plus particulièrement aux récifs coralliens dans plusieurs îles et archipels de la Mélanésie (Fidji, Vanuatu, Nouvelle-Calédonie) afin de dégager un certain nombre d’hypothèses comparatives au sujet des changements à moyen et long terme de l’interaction entre sociétés humaines et récifs coralliens.
Ce projet fédère différents membres de l’équipe EHESS/CREDO autour d’une problématique commune et comparative en couvrant des espaces insulaires et coralliens diversifiés. Il prépare l’extrapolation des hypothèses à d’autres régions du Pacifique (en particulier la Polynésie). Le bilan de ce projet exploratoire permettra de solidifier les recherches ultérieures sur des terrains plus spécifiques et d’entamer la collaboration avec les équipes du Labex qui travaillent en Polynésie, ainsi que dans les sciences environnementales.
MICRODIV
Diversity and dynamics of South‐Pacific coral Reef microbial communities
Porteur : Thierry Witrth
Montant : 25 000,00€
Current evidence obtained from the “first generation metagenomics” and massively parallel sequencing studies aiming at assessing collective- or meta-‐genomes from individual ecological niches, have revealed the dangers inherent in assuming that for microbes in the environment “everything is everywhere-‐the environment selects.” Collectively these studies have revealed that even napparently well-‐mixed systems, such as seawater and the atmosphere, striking spatial and temporal variations exist in the distributions of microbial species. Also, while these recent metagenomic studies have revealed extraordinary degrees of previously unappreciated viralandbacterial biodiversity at the ecosystem level ,few of these studies have been able to decipher the global significance of this biodiversity. This is partly due to a failure to link specific bacterial sequences to the particular hosts or habitat. Here we plan to investigate the bacterioplankton diversity in the coral triangle : the epicentre of marine biodiversity and potentially the epicentre of bacterioplankton diversity as well. Our project aims to understand the genetic structure, and diversity of the bacterioplankton present in coral reefs water column in a large phylogeographic frame. The parallel study of fish, coral and bacterial diversitie might provide new insights in the complexity and resilience of coral reefs.
In a second step we would like to improve our understanding of the bacterial diversity in the Tuamotu’s where the diversity seems to be explained alone by the coral reef surface. This exciting preliminary result needs further investigations but seems to advocate strongly in favour of the unified neutral theory of biodiversity proposed by Hubbell. Therefore, the coral reef bacterioplankton might turn into a paradigmatic example.
SYMBIOCOMP
Biodiversité génétique des Symbiodinium présents chez les éponges et les opisthobranches de Tahiti et Moorea : caractérisation et analyse comparative
Porteur : Véronique Berteaux
Montant : 30 000,00€
Les symbioses jouent un rôle important dans l’environnement marin, notamment celles à zooxanthelles. Ces algues, dinoflagellés du genre Symbiodinium, se retrouvent chez différents invertébrés tels les éponges, les opisthobranches, les anémones, les foraminifères, les bénitiers mais c’est chez les coraux, constructeurs de récifs, que cette symbiose est la plus étudiée. En effet, la balance, au sein du polype, des différents clades de zooxanthelles, aux propriétés physiologiques différentes, semble avoir un rôle clé dans la résistance des coraux face au stress. Néanmoins, la régulation de l'abondance, face à un stress donné, d’un clade particulier dans le polype reste énigmatique : est-il à l’état de trace dans le polype et amplifié lorsque cela est nécessaire et/ou provient-il du milieu extérieur ? Alors que jusqu’à présent les études, quant à l’apport extérieur de zooxanthelles, s’orientent vers la colonne d’eau où elles se trouvent à l’état libre, une hypothèse alternative et/ou complémentaire serait la transmission inter-espèces de clades. En d’autres termes, peut-il y avoir des transferts horizontaux de symbiontes entre les divers organismes à zooxanthelles présents sur un même site ? Le projet proposé ici a pour objectif principal de mettre en place les éléments nécessaires à l’étude de cette problématique en apportant des connaissances nouvelles, nécessaires à l’élaboration d’un projet plus vaste sur la dynamique inter-espèces des zooxanthelles, via la caractérisation génétique des clades de zooxanthelles présents chez les éponges et les opisthobranches.
COREPAC
Contamination métallique et organique dans les réseaux trophiques des écosystèmes coralliens de l’océan Pacifique
Porteur : Yves Letourneur
Montant : 29 000,00€
Le projet proposé vise à caractériser le cheminement de la matière organique au sein des réseaux trophiques des écosystèmes coralliens en fonction, d’une part, du niveau trophique des organismes et, d’autre part, des caractéristiques environnementales des sites d’étude. Le couplage de plusieurs méthodes performantes (isotopes stables, chimie des contaminants métalliques et organiques) permettra de reconstituer les voies empruntées par la matière organique depuis la base du réseau trophique jusqu’à des prédateurs de haut rang. Cette approche permettra en outre de déterminer si les contaminants (métaux lourds et polluants organiques) suivent ces voies trophiques et s’ils s’accumulent dans les organismes composant ce réseau, dont certains sont régulièrement consommés par les populations humaines locales. Ces contaminants peuvent aussi constituer d’excellents biomarqueurs potentiels de la « qualité environnementale » dont les variations pourront ensuite être étudiées dans l’espace et le temps. Le travail envisagé portera sur les trois territoires français du Pacifique : Nouvelle-Calédonie, Wallis & Futuna et Polynésie Française.
DST
Spécialistes ou Généralistes, déchiffrage des stratégies trophiques des poissons coralliens par les isotopes stables de C et N)
Porteur : Yves Letourneur
Montant : 26 000,00€
La connaissance de la structure trophique et plus généralement des flux de matière organique au sein des populations et peuplements est indispensable à notre compréhension du fonctionnement des communautés coralliennes. En milieu récifal, la grande biodiversité est un frein à une approche « classique » par l’analyse des contenus stomacaux. L’utilisation des isotopes stables de C et N, sans toutefois remplacer les analyses stomacales, apporte des informations importantes sur les sources de carbone, les niveaux trophiques et la variabilité alimentaire. A partir d’une typologie des principaux groupes fonctionnels basée sur les traits de vie des espèces, ce projet propose d’analyser la « biodiversité alimentaire » au travers des valeurs en isotopes stables de C et N de poissons suivant deux gradients : a- de l’individu au peuplement ; b- du local au régional. L’objectif est de déterminer les principales stratégies alimentaires au sein de ces groupes fonctionnels et d’en évaluer les répercutions écologiques dans le fonctionnement des peuplements en fonction de facteurs locaux (ex. habitat, apports terrigènes, niveau de pêche) et régionaux (ex. type d’île, production océanique).
HYDROSOOI
Phylogéographie et connectivité des hydrozaires dans le sud-ouest de l’océan Indien
Porteur : Henrich Bruggemann
Montant : 27 000,00€
Les processus qui sous-tendent l’accumulation de biodiversité marine dans certaines aires relativement restreintes sont mal connus, malgré leur importance pour la conservation. Les hydrozoaires représentent un modèle biologique prometteur pour mieux comprendre les processus de diversification régionale en raison de leur diversité élevée, abondance et distribution ubiquiste sur les récifs coralliens et par la diversité de modalités de reproduction existant au sein de ce groupe. Par une approche intégrée des différents champs disciplinaires, biogéographie, génétique et biologie de reproduction, ce projet propose d’évaluer le rôle des traits biologies et les durées de vie larvaire associées dans la diversification (cryptique) des lignées et le maintien de la connectivité des populations au sein du sud-ouest de l’océan Indien, un hotspot de la biodiversité marine encore peu investigué.
Ce projet se repose une complémentarité entre une expertise unique sur la taxonomie et la biologique des hydrozoaires acquis au cours de >40 ans, les inventaires faunistiques dans différents archipels de l’océan Indien et les collections de >1200 spécimens et l’expertise des marqueurs génétiques à vitesses d’évolution différentes. Un doctorant déjà recruté à l’université de La Réunion travaillera à temps plein dans le projet.
DYPOCAMP
Effet des aires marines protégées sur la dynamique des populations de coraux : influence de l’herbivorie et de la compétition
Porteur : Lucie Penin
Montant : 30 000,00€
Au cours des dernières décennies, l’intensité, la fréquence et la diversité des perturbations naturelles et anthropiques subies par les récifs coralliens ont considérablement augmenté. En réponse à cette augmentation et pour faire face à des besoins de gestion accrus des milieux coralliens, des aires marines protégées (AMP) ont été mises en place dans de nombreuses zones récifales. Si les effets directs de ces AMP sur les organismes exploités ont été démontrés, leurs bénéfices sur la résilience des récifs via la préservation des interactions biotiques liant coraux, compétiteurs et herbivores restent mal connus. En particulier, l’effet des réserves sur les processus ayant lieu au cours des premiers stades du cycle de vie des coraux a été très peu étudié, bien qu’ils soient reconnus comme primordiaux dans la récupération des récifs. Dans ce contexte, le programme de recherche proposé a pour objectif de mieux comprendre les interactions liant les processus précoces de la dynamique des populations des coraux, la compétition, la prédation, et l’effet des AMPs, dans deux systèmes coralliens contrastés de l’Indo‐Pacifique, à la Réunion et en Nouvelle‐Calédonie. Pour atteindre cet objectif, ce projet réunit des chercheurs de 3 équipes du Labex CORAIL : Le laboratoire ECOMAR, de l’Université de La Réunion, l’UR CoRéUs de l’Institut de Recherche pour le Développement, et le Laboratoire LIVE de l’Université de la Nouvelle‐Calédonie.
Selective Mortality
Effects of alternate coral reef states on the larval attraction and subsequent survival of fish at recruitment
Porteur : David Lecchini
Montant : 26 000,00€
The present project aims to increase the scientific knowledge regarding the sensory world of fish larvae during their habitat selection and their subsequent mortality patterns according to the “quality” of the recruitment habitat in order to better understand the recruitment process in the context of global degradation of coral reefs. In the first axis, we will explore how fish larvae balance available cues (chemical and visual cues) to choose a microhabitat, particularly in the absence of a key recruitment inducer or preferred microhabitat (assumed to be present on live coral colonies in comparison to dead coral colonies). In the second axis, we will measure the strength of selective mortality at recruitment in two different alternate reef states (live vs. dead coral colonies)and explore whether gradients of selection are mediated by the effects of habitat quality onpredator density, growth, shifts in alimentation, condition, genetic diversity, and/or parasitism. Overall, this project conducted at Moorea Island will deal with the conditions which may facilitate survival of fish larvae or, in the contrary, which may cause higher mortalities as a consequence of "wrong habitat selection". As coral reefs are considered as a "wall of mouths" from the point of view of a fish larva which is looking for a proper habitat to recruit, it is fundamental to explore, what conditions can be considered favourable for settling marine species. Moreover, in the context of reef habitat destruction, our study may help to estimate the negative consequences of reef destruction for post-recruitment mortality of marine species.
COMETA
Conséquences du changement climatique et des apports anthropiques sur les capacités de calcification de deux récifs coralliens
Porteur : Fanny Houlbreque
Montant : 29 000,00€
Ce projet se propose d’analyser les conséquences du changement global, en particulier de l’acidification des océans, sur les capacités de calcification des récifs coralliens, dans le contexte de milieux récifaux anthropisés. Les deux sites d’étude sont la Nouvelle-Calédonie, dont le lagon est affecté par des apports terrigènes riches en métaux du fait de l’activité minière, et La Réunion, où les récifs frangeants sont soumis à des apports d’éléments nutritifs d’origine anthropique via la décharge de la nappe phréatique. Ce projet s’intéressera aux deux composantes de la calcification nette que sont la bio-construction par les coraux Scléractiniaires, et la dissolution par les bio-érodeurs, ainsi qu’au bilan global à l’échelle du platier récifal. De manière plus spécifique, il analysera (i) la capacité de résistance des Scléractiniaires aux effets croisés de l’acidification et des apports en métaux lourds, en fonction de leur morphologie ou de leur mode de nutrition (en Nouvelle-Calédonie), (ii) les taux de bio-érosion par les micro-perforants sur les deux sites, et la réponse de ces organismes aux effets croisés de l’acidification et des apports anthropiques, et (iii) l’influence du taux de saturation en aragonite sur les bilans de calcification à l’échelle du platier récifal (à La Réunion).
RESCO
La reproductions séxuée des coraux en Polynésie : un cas d’étude
Porteur : Laetitia Hedouin
Montant : 29 000,00€
Les changements globaux sont difficiles à modifier à l’échelle mondiale, mais la science peut jouer un rôle crucial au niveau local en réduisant les perturbations locales et en favorisant ainsi la protection des espèces marines pendant leur période reproductive. Dans ce contexte, il est important d’acquérir de nouvelles données sur les périodes de pontes des coraux afin de mieux comprendre quand et où les coraux pondent, mais aussi quels forçages environnementaux influencent ces périodes de pontes. Ce projet utilisera la Polynésie française comme un laboratoire naturel pour étudier la durée et la période de pontes des coraux scléractiniaires dans différentes îles de deux grands archipels avec comme objectif ultime de déterminer si des proxys (facteurs environnementaux) gouvernent les cycles reproductifs des coraux et si l’utilisation de tels proxys pour prédire les périodes et durée des pontes des coraux peut s’étendre à d’autres régions du monde.
A l’appel d’offre « bourse post-doctoral »
5 projets ont été retenu dans leur globalité et donc pour un montant de 2500,00 € chacun :
CCGF
Catastrophes et changement global à Fidji : impacts, représentations et pratiques sociales dans deux régions côtières (Nadi, Yasawas)
Porteur : Emilie Nolet sous la direction de Simone Pauwels
Nous examinerons comment les habitants de Fidji appréhendent les phénomènes d’origine naturelle et/ou anthropique qui perturbent l’environnement côtier et récifal : aléas climatiques et géologiques destructeurs comme les cyclones, les ondes de tempêtes et les tsunamis, ou processus de longue durée comme le changement climatique et le développement urbain (avec des conséquences comme l’érosion des côtes, le blanchiment du corail, la diminution de la biodiversité marine, etc.). Les recherches porteront sur les représentations sociales du risque et sur les réponses apportées par les communautés locales, mais aussi sur les conséquences sociales, politiques, économiques et culturelles de la dégradation des récifs et de l’environnement côtier. Nous étudierons aussi en quoi les transformations actuelles de la société fidjienne (développement économique et touristique, affaiblissement des structures sociales traditionnelles, etc.) modifient les modes d’exploitation et de conservation du milieu.Nous analyserons enfin les politiques de gestion ou de diminution des risques développées par les pouvoirs publics fidjiens et les organisations internationales, et comment elles entrent éventuellement en conflit avec les pratiques et les savoirs locaux. Nous nous appuierons sur des enquêtes ethnographiques réalisées dans la zone périurbaine de Nadi et dans l’archipel des Yasawas et sur des recherches documentaires.
3P
Analyses multi-échelles des structurations taxinomiques et fonctionnelles des peuplements de poissons coralliens de Polynésie Française
Porteur : Thomas Lamy sous la direction de Joachim Claudet
La Polynésie Française comporte cinq archipels fortement contrastés : Société, Tuamotu, Gambier, Australes et Marquises. De nombreuses données ont été recueillies sur les peuplements de poissons de ces archipels et leur environnement depuis 1980 par l’EPHE, l'IRD et le CNRS. Le présent projet est organisé autour de 2 volets complémentaires : 1- une approche comparative de la structure taxinomique multiéchelle des peuplements ; 2- une approche fonctionnelle et explicative de cette structuration. Le premier volet vise à identifier et à caractériser la part commune et la part variable de la structure taxinomique entre les différents archipels d’une part, et entre les lagons d’îles hautes et d’atolls d’autre part. Il évaluera et quantifiera les gradients taxinomiques en fonction de la diversité des habitats, de la production océanique ou du niveau de perturbation anthropique. Le second volet sera ciblé sur les différences fonctionnelles entre systèmes lagonaires d’îles hautes et ceux des atolls. Il s’agira notamment d’évaluer la reproductibilité de la nature et de la structuration des groupes fonctionnels d’un type de lagon à l’autre ainsi que l’influence des facteurs environnementaux et anthropiques sur cette structuration.
Where do we go now ?
Dispersion larvaire et changements environnementaux
Porteur : Ricardo Beldade sous la direction de Suzanne Mills
La dispersion larvaire des espèces marines est essentielle pour la continuité des populations, mais l’impact des changements environnementaux sur la dispersion n’est pas encore connu. Ce projet a deux objectifs : 1) estimer les niveaux d’auto-recrutement et les voies de dispersion de Amphiprion chrysopterus à Moorea ; et 2) étudier l’influence des conditions environnementales sur la production larvaires (aspects quantitatif et qualitatif) de ce poisson corallien.Ce projet embrasse terrain (capture et expérimentation) ainsi que des travaux en laboratoire (moléculaire, et endocrinologique et immunologique).Le projet va marier les complémentarités des différents partenariats: les expertises en endocrinologie, immunologie et en expérimentation en laboratoire du porteur de projet (Suzanne Mills, EPHE) avec les expertises en biologie moléculaire et en expérimentation sur le terrain desu partenaires (Serge Planes, CNRS-INEE et Cecile Fauvelot, IRD UR COREUS) avec les expertises chez les Cnidares, Anthozoaires et en expérimentation sur le terrain du partenaire (Mehdi Adjeroud, IRD UR COREUS). De plus, le projet va bénéficier d’une collaboration bien établie avec des chercheurs de LTER/Moorea. Le projet intégre des différents champs disciplinaires : moléculaire, endocrinologie et immunologie.
MarMer
Les Marquisiens et la mer. La Biodiversité marine et l’histoire de son exploitation aux Marquises
Porteur : Guillaume Molle sous la direction de Eric Conte
La compréhension de la relation entre les hommes et leur environnement insulaire est une thématique essentielle de la recherche archéologique dans le Pacifique, et constitue même une priorité pour les chercheurs anglo-saxons issus de la Cultural Ecology. Ces travaux s’intègrent à la notion, aujourd’hui en plein développement, d’ « anthroposystème ». Notre projet se propose de reconstituer l’histoire des rapports entre l’ancienne société marquisienne et son milieu naturel, à travers l’analyse de données archéologiques recueillies sur l’île de Ua Huka, qui fait l’objet d’un vaste programme de recherches depuis près de vingt ans. La profondeur chronologique offerte par les fouilles archéologiques nous permet d’envisager l’évolution de cet anthroposystème sur une période d’un millénaire, depuis les premiers peuplements humains jusqu’à l’époque dite européenne. Notre attention se focalisera sur l’exploitation des ressources marines (ichtyofaune, malacofaune, nacre), que ce soit à des fins alimentaires ou pour la fabrication d’outils à usage quotidien. Nous pourrons ainsi évaluer leur part quantitative et qualitative dans la diète des anciens Marquisiens. Plusieurs collaborations seront envisagées, particulièrement dans le cadre d’analyses génétiques, qui permettront également de dépasser le seul intérêt archéologique en considérant l’évolution de la biodiversité marine à travers le temps (disparition de certaines espèces, tailles des proies, variations des stocks), rejoignant ainsi des enjeux très actuels.
INCOCO
Interactions compétitives chez les coraux : influence des traits d’histoire de vie, effets des variations environnementales, et implications pour le maintien et la résilience des populations
Porteur : Mohsen Kayal sous la direction de Mehdi Adjeroud
Les récifs coralliens sont fortement en déclin à travers la planète et souffrent des effets croissants des changements globaux. Comprendre les mécanismes de régulation des populations de coraux et identifier les facteurs qui déterminent sa variabilité sont aujourd’hui fondamentaux pour identifier les espèces les plus menacées et les plus résistantes (winners vs loosers), et ainsi estimer la capacité de résilience des communautés récifales. Le présent projet post-doctoral a pour but d’évaluer les interactions compétitives chez les coraux et d’examiner l’influence des facteurs intrinsèques (traits d’histoire de vie des taxa et caractéristiques des colonies) et extrinsèques (caractéristiques physico-chimiques des habitats, herbivorie et corallivorie). Les résultats permettront de mieux comprendre les processus de maintien et de régulation des populations de coraux, et de mieux appréhender l’effet des changements environnementaux sur leur capacité de résistance et de résilience. Ce projet concerne les récifs de la Nouvelle-Calédonie, où la forte diversité (~350 espèces de coraux) et les forts gradients environnementaux sont des atouts majeurs pour la réalisation de ce programme de recherche.