A l’appel d’offre « projet de recherche incitatif »
7 projets ont été retenu dans leur globalité et donc pour un montant de 25,000€ chacun
CompaRep
Transcriptomique Comparative de la Réponse des coraux face à différents stress : vers l’identification de biomarqueurs généralistes et spécifiques
Porteur : Véronique Berteaux-Lecellier (CNRS)
Montant : 25 000,00€
Une approche de transcriptomique comparative est à la base de ce projet qui vise i/en analysant par RNAseq des populations d’ARNs isolées lors de 3 stress induits
(thermique, acidification et pesticides) sur une même espèce de corail, à identifier des gènes spécifiquement impliqués dans la réponse à un stress donné ii/ en utilisant les données obtenues en i/ et en analysant les données de transcriptomiques obtenues sur d’autres espèces de coraux, à préciser si les réponses spécifiques ciidentifiées sont similaires pour des coraux de même espèce mais phylogéographiquement indépendants et à plus grande échelle, quelle que soit l’espèce de corail. Au delà de l’identification de gènes marqueurs de stress, ce projet est à la base du développement, grâce à un partenariat international Australie-Polynésie, d’un modèle expérimental « corail de laboratoire ».
Puzzle
Poissons récifaux – Le chainon manquant de la biodiversité entre ouest et centre Pacifique
Porteur : René Galzin (EPHE)
Montant : 25 000,00€
La distribution inégale de la biodiversité à l’échelle de la planète constitue un des principes fondamentaux de l’écologie avec des paramètres structurant cette diversité variant géographiquement, que ce soit en milieu terrestre ou marin. L’essence même d’une stratégie de conservation de la biodiversité est basée sur ce contexte géographique, dans la mesure où il est essentiel d’identifier les lieux d’intérêt faunistique et floristique pour ensuite mettre en place des mesures de protection adaptées.
Au cours des dix dernières années nous avons investigué la biodiversité ichtyologique pour 3 des bornes nord, sud et est de la Polynésie française. Le projet proposé aujourd’hui nous permettra de boucler ce bornage en étudiant la dernière borne ouest. La collecte de la dernière pièce du puzzle polynésien nous donnera ainsi une base de données performante afin de pouvoir répondre à des appels d’offres nationaux ou internationaux sur le thème.
COCAUNUT
Balance Autotrophie/Hétérotrophie chez les coraux
Porteur : Fanny Houlbreque (IRD)
Montant : 25 000,00€
Une approche alliant à la fois des analyses physiologiques et isotopiques des coraux, des mesures isotopiques des sources potentielles de nourriture ainsi que des analyses chimiques de l’eau sera réalisée afin de mieux comprendre l’acquisition de nutriments autotrophes et hétérotrophes par les coraux scléractiniaires. Pour cela, des colonies appartenant à différentes espèces coralliennes seront échantillonnées dans le lagon calédonien et sur un platier récifal de la Réunion sur trois stations différentes afin de déterminer si selon leurs conditions environnementales (conditions oligotrophes ou eutrophes) les coraux se basent davantage sur une nutrition auto- ou hétérotrophe. La capacité hétérotrophe et la capacité d’acquisition des nutriments inorganiques de chacune des espèces coralliennes seront également mesurées directement en conditions de laboratoire. Ce projet s’inscrit clairement dans une volonté d’améliorer les connaissances concernant la balance énergétique des coraux, de manière à pouvoir estimer leur potentiel d’adaptation et d’acclimatation face aux changements climatiques. Ce projet permet de mettre en commun les compétences de quatre laboratoires : l’UR CoReUs, ECOMAR, le LEMAR et le Centre Scientifique de Monaco.
Coralshark
Dynamique et connectivité entre îles coralliennes de deux espèces de requin (Carcharhinus melanopterus and Carcharihinus amblirynchos) : étude par application de méthodes NGS (Next Generation Sequencing)
Porteur : Michel Veuille (EPHE)
Montant : 25 000,00€
Nous utiliserons les méthodes de séquençage NGS (next generation sequencing) pour détecter la signature de changements majeurs dans l’histoire passée des populations de deux espèces de requins typiques des récifs coralliens : Carcharhinus melanopterus and Carcharhinus amblirynchos. Ces requins sont des composantes originales de l’écosystème coralliens en tant que prédateurs. Ce sont aussi des vertébrés ayant des propriétés dispersives inverses de celles des téléostéens, car ce sont les adultes qui y sont la forme dispersive, du fait de leur mode de reproduction ovovivipare. Nous analyserons les données de deux manières : d’une part en utilisant les programmes classiques (Beast, Baps, Geneland.) ; d’autre part en développant une approche en ABC (Approximate Bayesian computation) destinée à détecter les changements de taille efficace et de taux de migrations avec le temps. Nous souhaitons savoir si les populations de requins ont subi des changements majeurs au cours des dernières périodes du Pléistocène, et si les changements ainsi détectés pourraient être associés à des événements globaux, tels que les changements climatiques.
EXCESS
Exo et endo-symbiontes coralliens : variabilité des interactions sous l’effet du stress sédimentaire
Porteur : Lucie Penin (UR)
Montant : 25 000,00€
Les coraux, organismes ingénieurs des écosystèmes coralliens, sont le siège de nombreuses interactions biotiques. Leur structure complexe leur permet d’entretenir des associations mutualistes avec une large diversité de macro-vertébrés et invertébrés exosymbiontes (par exemple, crabes, crevettes), ainsi qu’à des microorganismes endo-symbiotiques, tels que les algues dinoflagellés du genre Symbiodinium. Ces endo- et exo-symbiontes sont connus pour jouer un rôle crucial dans les capacités de résistance et de résilience des coraux à différents types de perturbations (par exemple, stress thermique ou sédimentaire, explosions démographiques de prédateurs, maladies coralliennes).
Dans le contexte actuel d’augmentation de la fréquence et de l’intensité des perturbations naturelles et anthropiques subies par les récifs coralliens, il est urgent de mieux comprendre les interactions liant ces endo- et exo-symbiontes aux coraux hôtes et leurs rôles dans la résistance de leur hôte face aux stress environnementaux. En particulier, le stress sédimentaire directement lié au développement des activités humaines dans les bassins versants à l’aplomb des récifs menace de nombreux récifs du globe, mettant en péril le maintien des communautés coralliennes. La présente étude a donc pour objectif d’étudier l’effet de la sédimentation sur les interactions entre les algues endo-symbiotiques et les organismes exo-symbiotiques d’un même hôte corallien à différents stades de son cycle de vie (juvéniles vs. adultes), et dans deux systèmes récifaux de l’Indo-Pacifique : la Réunion et la Nouvelle Calédonie.
COLLARGOL
Collectage, Dispersion Larvaire intra-lagon et Perliculture : de l’étude de cas à la généralisation
Porteur : Serge Andrefouet (IRD)
Montant : 25 000,00€
Le projet vise à initier des modèles couplés hydro-biologiques sur plusieurs lagons d’atolls et d’îles hautes afin de simuler de manière réaliste la dispersion intra-lagon des larves d’huîtres perlières Pinctada margaritifera, et de mieux comprendre et gérer les opérations de collectage in situ.
L’objectif est donc de définir les spécifications de modèles adaptés à chaque configuration « géomorphologie-environnement-exploitation-stocks sauvage » tel qu’on peut les rencontrer en Polynésie française ou aux Iles Cook. Le travail demande une analyse des différentes configurations (lors d’un workshop en phase 1) mais aussi une analyse de sensibilité conduite à partir de deux modèles hydro-biologiques existants (phase 2).
Cette action incitative demande la participation des équipes travaillant aujourd’hui sur le sujet : IRD (U227 Coréus, UR 241 EIO), Ifremer-COP/U241 EIO, Ifremer-DYNECO/PHYSED, et de leurs partenaires.
L’ensemble des résultats du projet COLLARGOL doit permettre ensuite de soumettre des demandes de financement pour développer des modèles couplés hydro-bio appliqués à la perliculture sur différents sites.
DYNACANTH
Dynamique des proliférations d’Acanthaster planci : comprendre pour mieux gérer
Porteur : Pascal Dumas (IRD)
Montant : 25 000,00€
Les étoiles de mer corallivores Acanthaster planci sont une cause majeure de destruction des récifs coralliens : plus du tiers des récifs du Pacifique sont actuellement touchés par des épisodes d’ «explosions démographiques» dont la dynamique reste mal comprise. De fait, le bilan des actions de gestion prises par les acteurs locaux apparaît actuellement très mitigé. C’est par exemple le cas au Vanuatu, fortement affecté par des proliférations récurrentes d’A. planci, où les communautés villageoises utilisent des techniques de collecte rudimentaires dont les impacts écologiques sont totalement inconnus.
Mené par un consortium pluridisciplinaire, le projet incitatif proposé ici vise à étudier la structure (démographique, génétique) des populations, la dynamique de prolifération et la résistance immunitaire d’A. planci dans des contextes contrastés au Vanuatu (sites avec proliférations anciennes récurrentes) et en Nouvelle-Calédonie (sites en début d’infestation). Au-delà des avancées théoriques attendues, ce projet a pour ambition de développer une approche méthodologique novatrice et participative, permettant d’optimiser la gestion et le suivi des proliférations des acanthasters par les communautés insulaires.
5 projets ont été retenus pour un financement incitatif partiel (le Conseil Scientifique tient à souligner que les projets retenus avec des financements partiels ont été l’objet de remarques des rapporteurs qu’il conviendra de prendre en compte dans la réalisation des projets) :
Mecano
Mise en evidence des mécanismes chimiques et biochimiques permettant aux poisons de lutter contre les parasites à cycles direct
Porteur : Pierre Sasal (CNRS)
Montant : 20 000,00€
Dans ce projet, nous nous proposons de faire une étude comparée des mucus et des niveaux d’expression de gènes liés à l’immunité chez 10 espèces de poissons de la famille des Chaetodontidae en Polynésie. En effet, nous avons pu mettre en évidence lors d’études épidémiologiques que certaines espèces étaient plus ou moins parasitées par des monogènes de la famille des Dactylogyridae. Parmi ces espèces, une, Chaetodon trifasciatus n’est jamais parasitée par ces parasites. Nous souhaitons donc voir si cette espèce présente des particularités mécaniques, chimiques ou biochimiques lui permettant de ne pas être parasitée. Pour cela nous étudierons le mucus et l’immunité innée de ces différentes espèces.
BLIP
Barcoding des larves et juvéniles de poissons récifaux de l’Indo-Pacifique
Porteur : Philippe Borsa (IRD)
Montant : 18 000,00€
Le présent projet s‟inscrit dans la compréhension des mécanismes et les processus qui maintiennent la biodiversité dans les écosystèmes récifaux (axe 2 du Labex). Il concerne le développement des outils d‟identification qui permettront in fine d‟aborder la composition et la structure des communautés de larves et juvéniles de poissons récifaux, étudiées au niveau de précision de l‟espèce. Les différentes étapes du projet seront, par ordre chronologique : (1) la confrontation des bases de données génétique et photographique existantes et la planification des expériences nécessaires en vue de les compléter pour trois familles sélectionnées (Lethrinidae, Serranidae, Siganidae) ; (2) la production de séquences COI de larves afin d‟établir une base de données d‟images haute-résolution de référence ; (3) l‟analyse phylogénétique et phylogéographique des jeux de données de séquence existants et nouvellement acquis, et leur lien avec la variabilité morphologique ; pour chaque espèce, deux facteurs de variabilité morphologique des larves et juvéniles seront pris en compte et analysés en conséquence : la taille individuelle (en tant que proxy de l‟âge de l‟individu) et l‟origine géographique.
EFFLOREX
Efflorescence du phytoplancton dans les lagons exploités de Polynésie : potentiel nutritionnel et toxique
Porteur : Bruno Delesalle (EPHE)
Montant : 20 000,00€
Les efflorescence du phytoplancton sont mal connues en milieu corallien et en Polynésie française (tant l'identité des algues que le déterminisme des proliférations), alors que les changements climatiques les rendent plus fréquentes. Par ailleurs, les espèces proliférantes pourraient contribuer à l'amélioration de la nourriture des naissains en aquaculture nacrière. Le projet a donc un double objectif : une meilleure connaissance de ces crises dystrophiques et la recherche d'espèces "fourrages" pour la perlicultures.
Ces objectifs seront atteints par le déclenchement d'efflorescences artificielles en mésocoms, couplé à l'étude du phytoplancton dans un atoll perlicole ayant connu des efflorescences. Les résultats attendus visent également à une meilleure surveillance du risque lié aux biotoxines marines en Polynésie.
UV-Tox
Les filtres UV minéraux contenus dans les crèmes solaires sont ils sans danger pour les récifs coralliens : TOXicité des nanoparticules vs microparticules ?
Porteur : Laetitia Hédouin (CNRS)
Montant : 20 000,00€
Les crèmes solaires sont le produit phare pour se protéger du soleil mais aujourd'hui il existe une réelle polémique sur le danger potentiel que représentent les crèmes solaires pour les écosystèmes aquatiques. En effet, certains filtres UV minéraux ou chimiques contenus dans les crèmes solaires sont capables de perturber les fonctions endocriniennes, d'avoir des effets sur la fertilité, et donc de présenter un danger grave pour la santé humaine et animale. Les filtres UV minéraux comme le dioxyde de titane (Ti02) ou l'oxyde de zinc (ZnO) sont souvent utilisés sous forme de nanoparticules pour diminuer l'effet de traces blanches laissé par les microparticules de Ti02 et de ZnO. Malgré une utilisation croissante des nanoparticules dans le secteur des cosmétiques, les risques émergeants pour la santé et l'environnement demeurent largement méconnus. Dans ce contexte, l'objectif de ce projet UV-Tox est de mieux comprendre les effets écotoxicologique des filtres UV minéraux (TiO2 et ZnO sous forme de nanoparticule vs microparticule) contenus dans les crèmes solaires sur deux organismes emblématiques des récifs coralliens, les coraux et les poissons afin de pouvoir identifier les filtres UV minéraux les moins nocifs pour les récifs coralliens.
Teke-Teke
Etude spatio-temporelle du potentiel reproducteur des bénitiers Tridacna maxima en Polynésie française : du stress environnemental au renouvellement des populations
Porteur : Nabila Gaertner-Mazouni (UPF)
Montant : 20 000,00€
Le bénitier (Tridacna maxima) constitue une ressource alimentaire importante pour les populations Indo-Pacifique. Le renouvellement de la ressource est contraint par les stress environnementaux qui induisent la ponte, par son potentiel reproducteur, et par son recrutement. Toutefois, le lien entre ces paramètres est peu quantifié. Dans ce projet, nous proposons une stratégie originale afin d’évaluer dans 2 archipels de Polynésie les conséquences que peuvent avoir les facteurs environnementaux sur le renouvellement de la population de T. maxima. Ce projet fait appel aux expertises complémentaires de trois institutions membres du LABEX : l’IRD (UR 227- COREUS), l’Ifremer de Tahiti (UMR 241- EIO), et l’Université de Polynésie française (UMR 241- EIO), et deux co-financements extérieurs au LABEX (GOPS & DRM).
A l’appel d’offre « Workshop »
1 projet de Workshop a été retenu pour un financement de 19 890,00€
MPACONNECT
L’intégrité des données de connectivités empiriques dans la conception des réseaux d’aires marines protégées
Porteur : Glenn Almany (CNRS)
Montant : 19 890,00€
L'atelier proposé vise à développer des nouvelles théories et des outils pour apporter une nouvelle compréhension aux processus de dispersion larvaire et de connectivité des populations afin d'améliorer le design et la résilience des réseaux d'aires marines protégées afin qu'ils puissent réaliser le double objectif de conservation de la biodiversité et de la durabilité des pêches. Comme les réseaux d'aires marines protégées peuvent être vus comme des métapopulations, la persistance du réseau dépend d'une connectivité adéquate entre les parties du réseau. La persistance à long-‐terme du réseau nécessite donc de prendre en compte l'information sur la connectivité dans le design du réseau. Cependant, cela n'a jamais été fait jusqu'à maintenant car nous manquons à la fois de données empirique et de la théorie pour accomplir cette tâche.
A l’appel d’offre « Bourse Post-Doctorale »
4 projets ont été retenus
Resicor
Etude multidisciplinaire de la RESilience des CORaux scléractiniaires ayant subit un blanchissement : perte de Symbiodinium vs prolifération des cnidocytes et des cyanobactéries.
Porteur : Véronique Berteaux-Lecellier (CNRS)
Le projet RESICOR investiguera, au travers de 2 questions, les mécanismes de résilience des coraux et la manière dont ceux-ci pallient la perte de Symbiodinium (principale ressource nutritive) suite au blanchissement: 1) Y'a-t-il, lors du blanchissement et de la résilience qui s'en suit, multiplication et différenciation cellulaire des cnidocytes et des mucocytes, cellules spécialisées de l'épiderme qui protègent le corail et lui permettent de capturer des proies? Cette approche histologique de l’étude du passage potentiel à un mode de nutrition plus hétérotrophe utilisera des techniques immunohistochimiques et des mesures des signatures isotopiques (δ13C et δ15N) chez des coraux stressés (blanchis), en résilience et non-stressés; 2) Les cyanobactéries pourraient-elles jouer un rôle protecteur ou de ressource alternative pour le corail? Nous utiliserons l'hybridation in situ pour localiser ces organismes dans le corail blanchi et en résilience et nous les quantifierons, ainsi que les Symbiodinium, par PCR quantitative. Cette étude apportera pour la 1ère fois, des données sur une différenciation/multiplication cellulaire qui serait induite lorsque le corail est soumis à un stress.
DIADOM
Diazotrophs and Dissolved Organic Matter in coral reefs
Porteur : Cophie Bonnet (IRD)
The main objective of this project is to investigate relationships between atmospheric heterotrophic nitrogen (N2)-fixing microorganisms and organic matter exuded by corals (‘mucus’) in the New Caledonian lagoon. We will investigate a potential ‘external’ mutualistic relationship with nutrition benefits for the corals. In addition, this project will conduct preliminary tests of the technical requirements to measure the transfer of nitrogen fixed by N2-fixing microorganisms to the corals.
Given the high abundance of heterotrophic N2-fixing microorganisms in the New Caledonian coral lagoon, these organisms are bound to have a key role in nitrogen cycling within the coral reef ecosystem which this project will identify and quantify.
This project brings together members of the LABEX CORAIL from IRD, CNRS and University of French Polynesia.
EXECO
Effet de la sédimentation sur les organismes Exo- et Endo- symbiotiques, acteurs dans la performance des Coraux Scleractiniaires
Porteur : Cécile Fauvelot (IRD)
Les coraux, organismes ingénieurs des écosystèmes coralliens, sont le siège de nombreuses interactions biotiques. Leur structure complexe leur permet d’entretenir des associations mutualistes avec une large diversité de macro-vertébrés et invertébrés exo-symbiontes (par exemple, crabes, crevettes), ainsi qu’à des micro-organismes endo-symbiotiques, tels que les algues dinoflagellés du genre Symbiodinium. Ces endo- et exo-symbiontes sont connus pour jouer un rôle crucial dans les capacités de résistance et de résilience des coraux à différents types de perturbations (par exemple, stress thermique ou sédimentaire, explosions démographiques de prédateurs, maladies coralliennes).
Dans le contexte actuel d’augmentation de la fréquence et de l’intensité des perturbations naturelles et anthropiques subies par les récifs coralliens, il est urgent de mieux comprendre les interactions liant ces endo- et exo-symbiontes aux coraux hôtes et leurs rôles dans la résistance de leur hôte face aux stress environnementaux. En particulier, le stress sédimentaire directement lié au développement des activités humaines dans les bassins versants à l’aplomb des récifs menace de nombreux récifs du globe, mettant en péril le maintien des communautés coralliennes. La présente étude a donc pour objectif d’étudier l’effet de la sédimentation sur les interactions entre les algues endo-symbiotiques et les organismes exo-symbiotiques d’un même hôte corallien à différents stades de son cycle de vie (juvéniles vs. adultes), et dans deux systèmes récifaux de l’Indo-Pacifique : la Réunion et la Nouvelle Calédonie.
GAME
Cycle de GAMEtogénèse des coraux Porites sp. en Indo-Pacifique : influence des facteurs environnementaux
La sensibilité des espèces de coraux diffère face aux perturbations environnementales, également en fonction de leur stade de vie (e.g. adultes, gamètes, larves). Les coraux du genre Porites sont des espèces massives, particulièrement grandes et âgées présentant une plus faible vulnérabilité aux variations environnementales que d'autres espèces coralliennes (e.g. Acropora sp.). Cette résistance observée chez les adultes n'a jamais été observée chez les plus jeunes stades de vie en raison du manque de connaissances existant sur la reproduction sexuée des coraux Porites et sur les évènements de pontes. Dans ce contexte, l'objectif du projet GAME sera de caractériser le cycle de gamétogenèse des Porites sp. massifs dans quatre sites de la région Indo-Pacifique (Polynésie française, La Réunion, Nouvelles Calédonie et Australes) e les facteurs environnementaux (température, lumière, vents, pluie, cycle lunaire) susceptible d'influencer le cycle de reproduction pour chaque site d'étude.
Porteur : Laetitia Hédouin (CNRS)